Les points de Prestige sont la nouvelle forme de gagner des "niveaux" sur Rise of Omegas. Etant donné que le RP se passe 5 ans après Miyagawa, vous avez d'une certaine manière quasi-atteint la maîtrise de vos pouvoirs. Cependant, pour garder un certain ordre hiérarchique, les points de Prestige ont été créé. Chaque mission vous donne un certain nombre de points, et plus vous en aurez, plus votre grade militaire sera élevé, et donc, plus votre accès à certains composants d'équipement ou autre objets à la boutique vous seront débloqués.